[ 現 況 ］
為合理保障營運效能的提升、資產的安全，以及財務報導的可靠性及相關法令的遵循，特依據「私立學校法」及「學校財團法人及所設私立學校內部控制制度實施辦法」，訂定「嘉南藥理科技大學內部控制制度實施辦法」；並於99學年度成立稽核組，負責全校內部控制與稽核相關業務。自112年8月1日起，由秘書室稽核組，調整後成立稽核室，並隷屬於校長室，協助校長檢核內部控制制度的有效程度，衡量學校營運的效果及效率，適時提供改進建議，確保內部控制制度得以持續有效實施。
[ 組織架構 ］
本校稽核室隸屬校長室，置主任1人；並由稽核室主任及兼任稽核人員，組成稽核室團隊；兼任之稽核人員，經校長遴選校內學有專精之適當人員，約4至6人擔任，任期為1年。本室組織架構如下：
[ 發展目標 ］
本校各單位依據業務項目，須分別訂定內部控制作業，內容含括：作業程序、作業流程、內部控制點、自行檢查表及風險評估表等，彙整成本校「內部控制制度」，經本校財團法人董事會通過後實施。稽核室目標及發展，說明如下：
規劃內部稽核計畫：
內部稽核分為定期性稽核及專案性稽核，依風險評估，考量應受稽核內部控制作業項目及頻率，編列「內部稽核計畫表」，撰寫成「內部稽核計畫」，並簽陳校長核准後實施。
稽核種類、範圍及時間：
- 定期性稽核：例行性之內部控制作業項目，各單位每學年至少接受一次定期性稽核，受稽核之內部控制作業項目及期程，規劃於「內部稽核計畫表」中。
- 專案性稽核：本校執行各項重大專案計畫之稽核；諸如：教育部整體發展獎勵補助經費運用、承接政府機關計畫、中長程校務發展計畫及校長臨時性交辦業務等。稽核期程及時間依重大專案計畫，就各單位的別特性規劃，儘可能融入於「內部稽核計畫表」。
- 稽核人員應於稽核前，通知受稽核單位及確認稽核範圍。
稽核工作執行：
- 執行稽核時，受稽核人員需確實提供相關資料或回答所詢問之各項問題。
- 執行稽核時，倘有不符合事項時，應知會該單位主管，以澄清其不符合事項是否存在。
- 執行稽核時，將稽核過程及所發現缺失記錄於工作底稿，編製「內部稽核報告」，依行政程序陳校長核定，並請校長核示需進行後續追蹤改善事項。
- 內部稽核報告、工作底稿及相關資料，應至少保存5年。
缺失追蹤改善：
- 稽核人員，依校長核示需進行後續追蹤改善事項，撰寫「內部稽核追蹤改善表」通知受稽核單位，持續追蹤查核受稽核單位之改善情形。
- 受稽核單位之改善事項，未於改善期限完成或未執行改善者，稽核人員應於「內部稽核缺失改善報告」中明確記載，並依行政程序陳送校長核閱。
- 本校稽核人員，應依規定對本校內部控制作業進行稽核，以衡量本校對現行人事、財務、營運及與關係人交易，所定政策及作業程序之有效性及遵循程度，並不得牴觸會計職掌。稽核人員職權如下：
- 本校之人事事項、財務事項、營運事項之事後查核。
- 本校現金出納處理之事後查核。
- 本校現金、銀行存款及有價證券之盤點。
- 本校財務上增進效率與減少不經濟支出之查核及建議。
- 本校之專案性稽核事項。
稽核人員教育訓練：
內部稽核人員，應持續參加稽核相關專業機構之教育訓練，以協助完善內部稽核制度，藉以提升稽核品質及能力，並增進執行效果，有效控制內部環境。
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